Третій сезон «Аліси в Пограниччі» завершує історію Арісу та Усагі, одночасно відкриваючи нові, похмуріші горизонти.
Герої, щойно повернувшись до життя в реальному світі, знову залучені до смертельних ігор. Цього разу загроза походить від вченого Рюдзі, одержимого ідеєю потойбіччя, який вступив у союз з Бандою — вічним мешканцем Пограниччя.
Арісу доведеться врятувати викрадену Усаги та розгадати останні таємниці Пограниччя. Фінальна гра вимагає від нього найбільшої жертви, але виявляється лише ілюзією, створеною Бандою. Кульмінацією стає зустріч зі Стражем, що спостерігає за Пограниччю зі страху перед власною смертю. Він пояснює, що карта Джокера є символом випадковості, що заповнює порожнечі між життям і смертю.
Зробивши вибір на користь життя, Арісу і Усаги повертаються в реальний світ, де на них чекає щасливе майбутнє. Проте передбачення Стража збувається: планету стрясають катаклізми. Фінал переносить дію у США та натякає на можливі нові історії у Пограниччі.
При цьому офіційно четвертого сезону не буде, тому історія Арісу та Усагі залишається завершеною саме на третьому сезоні, залишаючи фанатам можливість лише домислів щодо подальшої долі героїв.
